Las colección especiales de la Biblioteca Pública de Pontevedra están formadas por centros de interés permanentes, fondos patrimoniales y bibliotecas y colecciones de interés particular para Pontevedra
- Biblioterapia
- FEM (Biblioteca feminista)
- LGTBIQ
Localización: segunda planta
- Gastronomía
Localización: tercera planta
- RF (Rincón de famílias)
Localización: primera planta
- Fondos procedentes de la Desamortización (entre sus fondos a biblioteca cuenta con 10 incunables y 20 manuscritos así como una interesante colección de libros raros de los siglos XVI, XVII y XVI)
- Fondo Antiguo
- Depósitos de la colección de la Sociedad Arqueológica de Pontevedra y la Colección Sampedro
- Biblioteca Muruais, con obras francesas e inglesas sobre literatura y arte principalmente del siglo XIX
- Biblioteca de las hermanas Mendoza (una parte, otra puede consultarse en el Museo de Pontevedra)
- Fondo Incautación.
- Fondos de la Biblioteca del profesor Carlos Villar
- Biblioteca José Antonio Durán
- Facsímiles
Localización: depósito