As colección especiais da Biblioteca Pública de Pontevedra están formadas por centros de interés permanentes, fondos patrimoniales e biblitecas e coleccións de interese particular para Pontevedra
- Biblioterapia
- FEM (Biblioteca feminista)
- LGTBIQ+
Localización: segundo andar
- Gastronomía
Localización: terceiro andar
- RF (Recuncho de famílias)
Localización: primeiro andar
- Fondos procedentes da Desamortización (entre os seus fondos a biblioteca conta con 10 incunables e 20 manuscritos así como unha interesante colección de libros raros dos séculos XVI, XVII e XVII)
- Fondo Antiguo
- Depósitos da colección da Sociedade Arqueolóxica de Pontevedra e a Colección Sampedro
- Biblioteca Muruais, obras francesas e inglesas sobre literatura e arte, principalmente do século XIX
- Biblioteca das irmás Mendoza (unha parte, outra pode consultarse no Museo de Pontevedra)
- Fondo Incautación
- Fondos da Biblioteca do profesor Carlos Villar
- Biblioteca José Antonio Durán
- Facsímiles
Localización: depósito